生物信息AI精準(zhǔn)醫(yī)療科研平臺(tái)
AI生物信息科研平臺(tái)賦能科研和臨床應(yīng)用:該平臺(tái)已經(jīng)成功部署在湘雅醫(yī)院,北大醫(yī)學(xué)中心,中山醫(yī)院,交大附屬醫(yī)院等。公司戰(zhàn)略簽約國(guó)家衛(wèi)健委健康大數(shù)據(jù)平臺(tái):上海聯(lián)仁健康股份有限公司;上市公司上游企業(yè):安圖生物;
金??礎(chǔ)I精準(zhǔn)科研服務(wù)平臺(tái)持續(xù)十年服務(wù)國(guó)內(nèi)700多家科研院所,包括醫(yī)療,農(nóng)業(yè),微生物幾個(gè)方面。每年平臺(tái)上運(yùn)行科研項(xiàng)目最高達(dá)20000項(xiàng)以上,支持研究人員自行分析及發(fā)表近200篇SCI論文,為我國(guó)多組學(xué)生物信息科研提供強(qiáng)大引擎支持,每年節(jié)約科研經(jīng)費(fèi)上億元。
目前我們的系統(tǒng)包含了10種組學(xué),近100種計(jì)算模塊和無縫的傻瓜式操作可視化系統(tǒng),并可以通過私有云實(shí)現(xiàn)本地部署(醫(yī)院應(yīng)用場(chǎng)景),線上系統(tǒng)已經(jīng)為全國(guó)650多家機(jī)構(gòu)通過服務(wù),線下系統(tǒng)裝機(jī)了包括中山醫(yī)院,北大精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)多組學(xué)中心,天津腫瘤重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,湘雅醫(yī)院,上海交大醫(yī)學(xué)院等知名院所,具有領(lǐng)先和先發(fā)優(yōu)勢(shì)。
這套系統(tǒng)的涵蓋范圍極為廣泛。它包括基因組領(lǐng)域的家系分析和種群分析;外顯子組方面的腫瘤分析,涵蓋配對(duì)和不配對(duì)情況;轉(zhuǎn)錄組的小 RNA、lncRNA、ceRNA、單細(xì)胞、空間組等多個(gè)方向;表觀組的甲基化測(cè)序和芯片分析;蛋白組以及翻譯后修飾組的磷酸化、乙?;治觯淮x組、微生物組的 16S、18S、ITS 分析,還有宏基因組分析以及強(qiáng)大的多組學(xué)整合分析。在數(shù)據(jù)格式支持方面,它能夠處理列表(帶表達(dá)和不帶表達(dá))以及表達(dá)矩陣(歸一化或未歸一化)。分析工具更是豐富多樣,包括歸一化、數(shù)據(jù)填充、聚類(距離算法、降維算法)、差異分析、相關(guān)性分析、熱圖制作、韋恩圖繪制、GO/KEGG 富集和結(jié)果查詢繪圖、時(shí)序分析、網(wǎng)絡(luò)模型定制、回歸和各類神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)等。
其突出特點(diǎn)在于這是一個(gè)高度傻瓜化的系統(tǒng)。用戶只需要上傳一次數(shù)據(jù),就能夠從頭做到尾,無需再經(jīng)歷重復(fù)上傳、下載、修改、再上傳等費(fèi)事費(fèi)時(shí)的繁瑣操作。而且,系統(tǒng)生成的結(jié)果圖表可以直接用于文章發(fā)表。
比如高福院士在疾控中心獲取的樣本數(shù)據(jù)在系統(tǒng)中完成了全套數(shù)據(jù)解析,成功發(fā)表新冠引發(fā)系統(tǒng)免疫的機(jī)制文章;上海腫瘤研究所的一課題組在面對(duì)轉(zhuǎn)錄組和小 RNA 的耐藥數(shù)據(jù)時(shí),充分利用了系統(tǒng)強(qiáng)大的可視化能力。他們深入挖掘數(shù)據(jù),構(gòu)建了 10 個(gè)不同的功能網(wǎng)絡(luò),并進(jìn)行了嚴(yán)謹(jǐn)?shù)尿?yàn)證。最終,在短短半年內(nèi),成功發(fā)表了 5 篇 6 分以上的 SCI 論文。其中一位博士生更是憑借這些出色的科研成果,畢業(yè)后直接晉升為副教授。